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李永生，教授，博士/硕士生导师，主要研究方向为生物医学信息学、免疫信息学。获得教育部霍英东青年科学奖二等奖，中华医学奖、省政府科学技术奖等，入选黑龙江省青年科技人才、校十大杰出青年等。主持国家优秀青年科学基金、国家自然科学基金面上项目、省重点研发计划项目等10余项。主要研究成果发表于nature reviews genetics、cancer cell、trends in biochemical sciences、hepatology、nature communications、annals of internal medicine、cancer research等国际著名生命科学杂志，入选全球前2%顶尖科学家榜单。申请3项国家发明专利，获批软件著作权15项。 担任中国细胞生物学会功能基因组信息学与系统生物学学会理事；中国免疫学会青年工作委员会委员；中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会、合成生物医药专业委员会、大数据与真实世界研究专业委员会委员；美国基因与癌症治疗协会会员；黑龙江省人工智能学会理事；中国计算机学会生物信息学专委会委员；省免疫学会青年工作委员会主任委员；美国acsr基金评审专家等。 教育经历 2009.09 – 2014.06 哈尔滨医科大学 生物学（生物物理学） 博士 2004.09 – 2009.06 哈尔滨医科大学 生物技术（生物信息学方向） 学士 工作经历 2023.03 - 至今 哈尔滨医科大学 医工交叉学院 教授 2019.12 - 2022.12 海南医学院 生物医学信息与工程学院 教授、院长 2015.09 - 2019.11 哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 副教授 2018.08 - 2019.10 德克萨斯州大学奥斯汀分校 戴尔医学院 研究员 2016.10 - 2018.07 md安德森癌症研究中心 系统生物学系 博士后 2014.07 - 2015.08 哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院 讲师 科研项目 1. 国家自然科学基金委员会，优秀青年项目，重大疾病调控组的生物信息学研究, 2024-01-01 至 2026-12-31，200万，主持 2. 国家自然科学基金委员会，面上项目，恶性肿瘤关键遗传变异介导的rna结合蛋白调控网络扰动模型构建与分析, 2020-01-01 至 2023-12-31，58万，主持 3. 国家自然科学基金委员会，地区项目，基于多源数据融合的肿瘤免疫关键调控因子识别及作用机制研究，2021-01-01 至 2024-12-31，35万，主持 4. 国家自然科学基金委员会，青年项目, 融合多组学数据优化筛选恶性肿瘤中表观失调非编码rna及其功能研究，2016-01-01 至 2018-12-31, 21万元，主持 5. 海南省科技厅，省重点研发计划项目，基于单细胞测序解析热带病调控因子关键技术研究与应用，2021-09-01至2023-08-31，50万元，主持 6. 海南省科技厅，省自然面上项目，基于多层次功能网络扰动的癌症热点突变优化筛选及功能预测模型研究，2020-12-01 至 2023-12-31，5万元，主持 7. 中国博士后基金，特别资助，复杂疾病中长链非编码rna的识别及其调控机制研究， 2016-01-01 至 2019-04-01, 15万元，主持 8. 黑龙江省科技厅, 省自然科学基金青年项目, 恶性胶质瘤进展相关非编码rna调控网络及耦合模块挖掘算法研究，2015-07-01 至 2018-07-31，5万元，主持 代表性论文 1. yongsheng li#*, tiantongfei jiang#, weiwei zhou#, junyi li, xinhui li, qi wang, xiaoyan jin, jiaqi yin, liuxin chen, yunpeng zhang, juan xu*, xia li*. pan-cancer characterization of immune-related lncrnas identifies potential oncogenic biomarkers.nature communications 2020 feb 21;11(1):1000. doi: 10.1038/s41467-020-14802-2. (esi高被引论文，sci if=17.694) 2. yongsheng li#, daniel j mcgrail#, juan xu#, junyi li#, ning‐ning liu, ming sun, richard lin, rita pancsa, jiwei zhang, ju‐seog lee, hui wang, gordon b mills, xia li*, song yi*, nidhi sahni*. merit: systematic analysis and characterization of mutational effect on rna interactome topology. hepatology 2019 aug;70(2):532-546. doi: 10.1002/hep.30242. (sci if=17.298) 3. yongsheng li, brandon burgman, daniel j mcgrail, ming sun, dan qi, sachet a shukla, erxi wu, anna capasso, shiaw-yih lin, catherine j wu, s gail eckhardt, gordon b mills, bo li*, nidhi sahni*, s stephen yi*. integrated genomic characterization of the human immunome in cancer. cancer research 2020 nov 1;80(21):4854-4867. doi: 10.1158/0008-5472.can-20-0384. (sci if=13.312) 4. haozhe zou#, tao pan#, yueying gao#, renwei chen#, si li, jing guo, zhanyu tian, gang xu, juan xu*, yanlin ma*, yongsheng li*. pan-cancer assessment of mutational landscape in intrinsically disordered hotspots reveals potential driver genes. nucleic acids research 2022 may 20;50(9):e49. doi: 10.1093/nar/gkac028. (sci if=19.160) 5. jiwei zhang#, tao pan#, weiwei zhou#, ya zhang, gang xu, qi xu, si li, yueying gao, zhengtao wang*, juan xu*, yongsheng li*. long noncoding rna linc01132 enhances immunosuppression and therapy resistance via nrf1/dpp4 axis in hepatocellular carcinoma. journal of experimental & clinical cancer research 2022 sep 8;41(1):270. doi: 10.1186/s13046-022-02478-z. (sci if=12.658) 6. tiantongfei jiang#, weiwei zhou#, qi sheng#, jiaxin yu#, yunjin xie, na ding, yunpeng zhang*, juan xu*, yongsheng li*. immcluster: an ensemble resource for immunology cell type clustering and annotations in normal and cancerous tissues. nucleic acids research 2023 jan 6;51(d1):d1325-d1332. doi: 10.1093/nar/gkac922. (sci if=19.160) 7. dezhong lv, zhenghong chang, yangyang cai, junyi li, liping wang, qiushuang jiang, kang xu, na ding, xia li*, juan xu*, yongsheng li*. translnc: a comprehensive resource for translatable lncrnas extends immunopeptidome.nucleic acids research 2022 jan 7;50(d1):d413-d420. doi: 10.1093/nar/gkab847. (sci if=19.160) 8. jiwei zhang#*, shengli li#, lin zhang, juan xu, mingxu song, tingting shao, zhaohui huang*, yongsheng li*. rbp eif2s2 promotes tumorigenesis and progression by regulating myc-mediated inhibition via fhit-related enhancers. molecular therapy 2020 apr 8;28(4):1105-1118. doi: 10.1016/j.ymthe.2020.02.004. (sci if=12.910) 9. yongsheng li#, jinwen zhang#, caiqin huo#, na ding, junyi li, jun xiao, xiaoyu lin, benzhi cai*, yunpeng zhang*, juan xu*. dynamic organization of lncrna and circular rna regulators collectively controlled cardiac differentiation in humans.ebiomedicine 2017 oct;24:137-146. doi: 10.1016/j.ebiom.2017.09.015. (sci if=11.205) 10. yongsheng li#, brandon burgman#, ishaani s khatri, sairahul r pentaparthi, zhe su, daniel j mcgrail, yang li, erxi wu, s gail eckhardt, nidhi sahni*, s stephen yi*.e-mutpath: computational modeling reveals the functional landscape of genetic mutations rewiring interactome networks. nucleic acids research 2021 jan 11;49(1):e2. doi: 10.1093/nar/gkaa1015. (sci if=19.160) 11. yongsheng li#, lili li#, zishan wang#, tao pan, nidhi sahni, xiyun jin, guangjuan wang, junyi li, xiangyi zheng, yunpeng zhang*, juan xu*, song yi*, xia li*. lncmap: pan-cancer atlas of long noncoding rna-mediated transcriptional network perturbations. nucleic acids research 2018 feb 16;46(3):1113-1123. doi: 10.1093/nar/gkx1311. (sci if=19.160) 12. yongsheng li#*, jun xiao#, jing bai, yi tian, yinwei qu, xiang chen, qi wang, xinhui li, yunpeng zhang*, juan xu*. molecular characterization and clinical relevance of m6a regulators across 33 cancer types, molecular cancer 2019 sep 14;18(1):137. doi: 10.1186/s12943-019-1066-3. (esi高被引论文，sci if=41.444) 13. kang xu#, yangyang cai#, mengying zhang#, haozhe zou, zhenghong chang, donghao li, jing bai*, juan xu*, yongsheng li*. pan-cancer characterization of expression and clinical relevance of m6a-related tissue-elevated long non-coding rnas. molecular cancer 2021 feb 8;20(1):31. doi: 10.1186/s12943-021-01324-8. (sci if=41.444) 14. jun xiao#, xiaoyan jin#, chunlong zhang#, haozhe zou#, zhenghong chang, nan han, xia li*, yunpeng zhang*, yongsheng li*. systematic analysis of enhancer regulatory circuit perturbation driven by copy number variations in malignant glioma. theranostics 2021 jan 1;11(7):3060-3073. doi: 10.7150/thno.54150. (sci if=11.600) 15. yongsheng li#, nidhi sahni#*, rita pancsa, daniel j mcgrail, juan xu, xu hua, jasmin coulombe-huntington, michael ryan, boranai tychhon, dhanistha sudhakar, limei hu, michael tyers, xiaoqian jiang, shiaw-yih lin, m madan babu*, song yi*. revealing the determinants of widespread alternative splicing perturbation in cancer. cell reports 2017 oct 17;21(3):798-812. doi: 10.1016/j.celrep.2017.09.071. (sci if=9.995) 主讲课程 1. 生物信息学，生物信息专业本科生，8学时，2021-2023 2. 分子系统生物学，生物信息专业本科生，16学时，2020-2022 3. 基因组信息学，生物信息学专业研究生，32学时，2021-2022 4. 蛋白质组信息学，生物信息学专业研究生，32学时，2021-2022 5. 计算表观遗传学，生物信息学专业研究生，32学时，2021-2022 获奖情况 1. 李永生，2022，教育部霍英东青年科学奖二等奖 2. 李永生，2021，海南省千人专项领军人才 3. 李永生，2020，海南省拔尖人才 4. 李永生，2019，黑龙江省青年科技人才奖 5. 李永生，2018，ben f. love fellowship in innovative cancer therapies奖 6. 李永生，2017，the harold c. and mary l. daily endowment fund奖 7. 黑龙江省教学成果奖，“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践, 二等奖，2022，排名第二 8. 黑龙江省教学成果奖，适应新医科发展理念，医工结合创办生物信息专业，一等奖，2020，排名第三 9. 黑龙江省高校科学技术奖，基于生物数据融合的恶性肿瘤中mirna-cerna复合协同调控模式的研究，一等奖，2019，排名第三 10. 中华医学科技奖，癌风险mirna及协同调控风险通路(pathway)识别， 三等奖，2015，排名第六 11. 李永生，李霞，徐娟，发明专利，非编码rna基因协同调控作用的预测方法，2023年，中国（zl202111246827.7） 12. 徐娟，李永生，潘涛，发明专利，整合免疫肽组数据识别非编码区域的免疫表位的鉴定方法，2022年，中国 13. 李永生，徐娟，发明专利，一种识别非编码rna多肽的方法，2022年，中国 |
